เซลล์แบคทีเรียที่อยู่ภายในระบบทางเดินอาหารของมนุษย์ (GIT) มีจำนวนมากกว่าเซลล์ของโฮสต์ถึง 10 เท่า และยีนที่เข้ารหัสโดยแบคทีเรียที่อาศัยอยู่ใน GIT มีจำนวนมากกว่ายีนของโฮสต์มากกว่า 100 เท่า จุลินทรีย์ที่เกี่ยวข้องกับทางเดินอาหารของมนุษย์เหล่านี้เรียกว่าจุลินทรีย์ในลำไส้
ไมโครไบโอม ในลำไส้ของมนุษย์และบทบาทของมันทั้งในด้านสุขภาพและโรคภัยไข้เจ็บเป็นหัวข้อของการวิจัยอย่างกว้างขวาง โดยสร้างการมีส่วนร่วมในเมแทบอลิซึมของมนุษย์ โภชนาการ สรีรวิทยา และการทำงานของภูมิคุ้มกัน ความไม่สมดุลของจุลินทรีย์ในลำไส้ปกตินั้นเชื่อมโยงกับสภาวะของระบบทางเดินอาหาร เช่น โรคลำไส้อักเสบ (IBD) และโรคลำไส้แปรปรวน (IBS) และอาการแสดงทางระบบที่กว้างขึ้น
.gif "x5thi")
