สำหรับปัญหาบางอย่าง ซูเปอร์คอมพิวเตอร์ไม่ได้ยอดเยี่ยมขนาดนั้น เมื่อนักวิทยาศาสตร์และวิศวกรประสบปัญหายากๆ พวกเขาหันไปหาซูเปอร์คอมพิวเตอร์ คอมพิวเตอร์เหล่านี้เป็นคอมพิวเตอร์แบบคลาสสิกขนาดใหญ่มาก โดยมักมีแกน CPU และ GPU แบบคลาสสิกหลายพันคอร์ อย่างไรก็ตาม แม้แต่ซูเปอร์คอมพิวเตอร์ก็ยังพยายามแก้ปัญหาบางประเภท หากซูเปอร์คอมพิวเตอร์เกิดชะงักงัน นั่นอาจเป็นเพราะเครื่องจักรคลาสสิกขนาดใหญ่ถูกขอให้แก้ปัญหาที่มีความซับซ้อนระดับสูง เมื่อคอมพิวเตอร์แบบ
ควอนตัม ล้มเหลว มักเกิดจากความซับซ้อน ปัญหาที่ซับซ้อนคือปัญหาที่มีตัวแปรจำนวนมากโต้ตอบกันในรูปแบบที่ซับซ้อน การสร้างแบบจำลองพฤติกรรมของอะตอมแต่ละตัวในโมเลกุลเป็นปัญหาที่ซับซ้อน เนื่องจากอิเล็กตรอนที่แตกต่างกันมีปฏิสัมพันธ์ซึ่งกันและกัน การจัดเส้นทางในอุดมคติสำหรับเรือบรรทุกน้ำมันไม่กี่ร้อยลำในเครือข่ายการขนส่งทั่วโลกนั้นซับซ้อนเช่นกัน