วิธีที่ปลอดภัยที่สุดในการละลายลิ่มเลือดคือการปล่อยให้กระบวนการละลายลิ่มเลือดของร่างกายทำงานเอง ซึ่งอาจใช้เวลาหลายสัปดาห์หรือหลายปี แม้ว่าลิ่มเลือดบางส่วนจะไม่หายไป ในกรณีของการแข็งตัวของเลือดขนาดใหญ่หรือเป็นอันตรายถึงชีวิต
ลิ่มเลือดอุดตัน สามารถให้ยาละลายลิ่มเลือดผ่านทางสายสวนโดยตรงเข้าไปในหลอดเลือดที่อุดตันเพื่อละลายลิ่มเลือดที่เพิ่งเกิดขึ้น ยาละลายลิ่มเลือดมีความเสี่ยงที่จะมีเลือดออก ในสถานการณ์ฉุกเฉินบางอย่าง ลิ่มเลือดสามารถผ่าตัดเอาออกได้ แต่สิ่งนี้จะเพิ่มความเสี่ยงของการแข็งตัวต่อไปความเสี่ยงของการเกิดลิ่มเลือดซ้ำคืออะไรโอกาสที่จะเกิดลิ่มเลือดซ้ำนั้นขึ้นอยู่กับสถานการณ์ที่นำไปสู่การเกิดลิ่มเลือดครั้งแรก ตัวอย่างเช่น หากลิ่มเลือดเกิดขึ้นจากการผ่าตัดหรือการบาดเจ็บ โอกาสที่จะเกิดซ้ำก็ค่อนข้างต่ำ ในทางกลับกัน สำหรับผู้ที่เกิดลิ่มเลือดที่ยังไม่เกิดขึ้นและหยุดการรักษาหลังจากผ่านไป 6 เดือน โอกาสที่จะเกิดซ้ำคือประมาณ 20% ในช่วง 4 ปีแรก และประมาณ 30% หลังจาก 10 ปี