ปัญญาประดิษฐ์สามารถลดการทดลองและข้อผิดพลาดนี้ให้เหลือน้อยที่สุด แต่ยังคงอาศัยโครงสร้างผลึกของเอนไซม์ที่ได้มาจากการทดลอง ซึ่งอาจไม่มีหรือไม่มีประโยชน์อย่างยิ่ง ดังนั้น กรดอะมิโนที่เกี่ยวข้องที่ควรกลายพันธุ์ในเอนไซม์อาจเป็นเพียงการคาดเดาเท่านั้น ผู้ร่วมเขียนอาวุโสกล่าว เพื่อแก้ปัญหานี้ เราได้คิดค้นวิธีการจัดลำดับกรดอะมิโนที่ขึ้นอยู่กับลำดับกรดอะมิโนที่มีอยู่อย่างแพร่หลายของเอนไซม์อะนาล็อกจากสิ่งมีชีวิตชนิดอื่น นักวิจัยมุ่งเน้นไปที่กรดอะมิโนที่เกี่ยวข้องกับความจำเพาะของ
เอนไซม์ กับโมเลกุลที่เอนไซม์เปลี่ยนรูป และสารที่ช่วยให้การเปลี่ยนแปลงดำเนินต่อไป โดยการระบุลำดับกรดอะมิโนที่ไม่เปลี่ยนแปลงตลอดวิวัฒนาการ นักวิจัยระบุการกลายพันธุ์ของกรดอะมิโนที่ปรับให้เข้ากับสภาพเซลล์ที่แตกต่างกันในสปีชีส์ต่างๆ